法醫(yī)專家協(xié)助世界各地的執(zhí)法部門通過對證據(jù)進(jìn)行顯微觀察來確定嫌疑人是否無辜。在調(diào)查期間，他們會根據(jù)證據(jù)類型使用各種類型的宏觀顯微鏡和顯微鏡。數(shù)碼顯微鏡在法醫(yī)學(xué)中同樣發(fā)揮著重要作用，例如對槍支和工具痕跡、文件、法醫(yī)學(xué)、毛發(fā)和纖維，以及玻璃和油漆進(jìn)行顯微觀察。

　　槍支彈道調(diào)查的一項挑戰(zhàn)就是子彈和彈殼均由金屬制成，而金屬會在顯微鏡下會產(chǎn)生光反射。為了觀察到痕跡和標(biāo)記中最細(xì)小的細(xì)節(jié)，必須將這種反射保持在最低限度或者避免反射。實現(xiàn)這種目的的方法之一就是傾斜顯微鏡。文件和筆跡調(diào)查的常見方法是首先通過較低的放大倍率識別出文檔的可疑區(qū)域，然后再以較高的放大倍率觀察細(xì)節(jié)。因此可能需要頻繁改變放大倍率和物鏡。痕跡證據(jù)專家需要調(diào)查各類材料，從毛發(fā)、纖維、玻璃、金屬、紙張、油漆，到生物樣品。由于這些材料的特性差異很大，因此可能需要不同類型的照明以及從低到高的不同放大倍率。此外，創(chuàng)建拼接圖像和3D圖像對于掌握樣品的整體情況可能會很有幫助。